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Comparatif de logiciels

Les meilleurs logiciels de facturation et de suivi du temps

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5 minutes de lecture
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À partir de 2026, la facturation électronique deviendra progressivement obligatoire pour toutes les entreprises en France, avec un calendrier différencié selon leur taille. Des ajustements réglementaires sont encore possibles, mais anticiper cette transition reste le meilleur moyen de sécuriser vos processus.

Avec une solution qui relie facturation et gestion du temps, vous facturez au plus juste, réduisez les erreurs et gagnez en visibilité sur vos coûts. Découvrez notre comparatif 2025 des meilleurs logiciels et les réponses aux questions les plus fréquentes pour faire le bon choix !

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Pourquoi relier facturation et gestion du temps ?

Choisir un logiciel de facturation ne sert pas seulement à émettre des devis ou à générer des factures conformes. C’est aussi un levier pour mieux piloter vos ressources et anticiper les obligations légales, comme la généralisation de la facturation électronique dès 2026.

Un logiciel de facturation connecté à la gestion du temps (GTA) apporte des bénéfices concrets, tant pour les équipes RH que pour les finances.

Des factures plus fiables grâce aux feuilles de temps

Les heures saisies par vos collaborateurs (pointage, projets, plannings) sont intégrées directement dans la facture. Cela évite les doubles saisies et réduit les erreurs de facturation, un point clé pour les entreprises qui facturent au temps passé.

Une meilleure visibilité sur les coûts et la trésorerie

En liant facturation et GTA, vous suivez la rentabilité par client ou projet. Les managers disposent d’une vision claire :

  • heures facturables ;
  • coûts salariaux ;
  • marge dégagée.

Cette transparence facilite le pilotage financier et limite les mauvaises surprises de trésorerie.

Plus de productivité et moins d’administratif

Avec l’automatisation des relances, de la TVA ou des factures récurrentes, vos équipes passent moins de temps sur les tâches administratives.

Le gain est double :

  • rapidité pour l’entreprise
  • et satisfaction pour vos clients, qui reçoivent des factures claires et ponctuelles.

Un lien direct avec la paie et la comptabilité

Un logiciel qui relie GTA et facturation permet aussi d’exporter les données vers la paie ou la comptabilité sans rupture de flux. In fine, ce sont moins d’erreurs, des processus simplifiés et une meilleure conformité aux obligations légales.

🚀Avec le logiciel d’entreprise Factorial, les temps de travail validés par les managers alimentent à la fois la paie et la facturation. Vous centralisez RH, finance et suivi du temps dans une seule plateforme.

Quels sont les meilleurs logiciels de gestion des temps et de facturation ?

Désormais, les entreprises n’ont plus seulement besoin d’un outil pour créer des devis et envoyer des factures. Le choix du logiciel de facturation conditionne aussi la conformité légale, la fluidité des échanges avec la comptabilité et, de plus en plus, l’intégration avec la gestion du temps et des projets.

Les logiciels gratuits pour indépendants et micro-entrepreneurs

Pour les plus petites structures, plusieurs solutions gratuites restent incontournables :

  • Indy propose un module de facturation illimité et conforme ;
  • Abby automatise le livre des recettes ;
  • Facture.net intègre aussi un mini CRM ;
  • Henrri séduit avec ses relances automatiques ;
  • Zervant reste une alternative simple pour démarrer, même si sa version gratuite limite le nombre de factures.

Les solutions complètes pour TPE et PME

Les entreprises en croissance se tournent davantage vers des logiciels payants offrant plus de fonctionnalités :

  • Sellsy combine facturation et CRM, avec une brique d’intelligence artificielle intégrée ;
  • Evoliz se distingue par sa double certification NF203 et NF525 ;
  • Pennylane par sa vue 360° sur les finances ;
  • Axonaut par sa gestion tout-en-un incluant la trésorerie ;
  • Qonto ou Sage Business Cloud par leur approche simplifiée et connectée à la comptabilité.

Les outils spécialisés selon les besoins

Certains logiciels répondent à des usages très précis :

  • Tolteck est pensé pour le BTP, avec des devis adaptés aux artisans ;
  • Billings Pro intègre le suivi du temps travaillé directement dans la facturation, pratique pour les agences et freelances qui facturent à l’heure ;
  • Magniv Pro, enfin, propose une offre gratuite jusqu’à 5 000 € facturés par an, avec des formules accessibles ensuite.

Factorial : la solution qui combine RH, facturation et gestion du temps

Contrairement aux autres logiciels, Factorial n’est pas uniquement centré sur la facturation. C’est une plateforme complète qui relie la gestion du temps (GTA), la paie, les RH et bien sûr la production des factures. Les feuilles de temps validées par les managers alimentent directement la facturation et la paie, ce qui garantit une cohérence totale entre heures travaillées, coûts salariaux et factures émises.

Cette approche centralisée vous permet de centraliser toutes les données et limite drastiquement le risque d’erreurs de saisie.

logiciels de facturation et de suivi du temps

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FAQ – facturation et suivi du temps

Quel est le meilleur logiciel gratuit pour auto-entrepreneur ?

Indy, Abby, Facture.net et Henrri font partie des options les plus utilisées. Ces logiciels permettent d’éditer des factures conformes gratuitement, avec parfois des fonctionnalités additionnelles comme le suivi des paiements ou un mini CRM. Pour un indépendant qui débute, ils constituent un premier pas simple vers la facturation électronique.

Est-il obligatoire d’avoir un logiciel de facturation certifié ?

La facturation électronique deviendra progressivement obligatoire à partir de 2026, avec un déploiement échelonné selon la taille des entreprises. Même si des reports restent possibles, mieux vaut anticiper en adoptant dès maintenant une solution conforme.

Comment relier la facturation au suivi du temps de travail des salariés ?

Certaines solutions, comme Factorial, intègrent directement les heures travaillées dans le processus de facturation. Concrètement, les feuilles de temps validées alimentent la facture, ce qui réduit les erreurs et assure une facturation au plus juste. C’est un gain de temps pour les équipes et une meilleure transparence pour les clients.

Quels sont les 4 types de factures en comptabilité ?

On distingue :

  • la facture classique (émise pour une vente ou une prestation) ;
  • la facture d’acompte ;
  • la facture de solde ;
  • et la facture d’avoir (ou note de crédit).

Un bon logiciel de facturation doit permettre d’éditer ces différents formats en respectant les obligations légales.

Quel logiciel est le plus utilisé par les PME en France ?

Les PME françaises se tournent souvent vers des solutions comme Sellsy, Evoliz, Pennylane ou Sage Business Cloud, connues pour leur fiabilité et leur conformité.

Toutefois, de plus en plus d’entreprises choisissent des plateformes plus globales comme Factorial, qui combinent facturation, gestion du temps, paie et RH dans un seul outil. Réservez votre démo 100% personnalisée dès aujourd’hui.

Maya est Digital Content Specialist chez Factorial, où elle met sa plume digitale et son œil affûté pour les tendances RH au service d’un objectif : créer du contenu à forte valeur ajoutée pour aider les entreprises à simplifier et digitaliser leur gestion des ressources humaines. Et quand elle ne rédige pas sur l’avenir des RH, retrouvez-la sur le sable d’un terrain de beach volley.